別荘でごちそうの準備をするドキンちゃんに、「フルーツを持ってきて!」といわれて出かけたばいきんまんは、突然黒い雲の中に吸い込まれてしまいます。そこへ現れたのは黒いものが好きなくろゆき姫。ばいきんまんを「まっ黒でステキ」と一目で気に入ってしまいます。ばいきんまんはすっかりごきげん。ところが、くろゆき姫にまっ黒にされてしまい怒ったドキンちゃんは、ばいきんまんをとりあってくろゆき姫と大げんか!