本と勉強が大好きでちょっぴり気弱なジャック。どんな動物とも仲良くなれる冒険好きなアニー。仲良し兄妹のふたりは、ある日、森で大きな木の上に小屋を見つけた。中は立派な本であふれていて、心をうばわれてしまうジャック。そして恐竜ずかんを開いて思わず「行ってみたいなあ」とつぶやくと、たちまち小屋が光に包まれ、ぐるぐると回りはじめた。気がつくと、何とそこは恐竜の王国だった!プテラノドンのヘンリーと仲良くなったり、恐竜の世界を冒険するうちに、ふと草むらで金のメダルをみつけた。やがてふたりは、この不思議な木の家「マジック・ツリーハウス」から本の世界に飛び込み、中世のお城の世界、古代ローマの世界、海賊の世界へと、4つの金のメダルを探す冒険へ旅立つのだった――。

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