サトシとピカチュウたちは"大地の剣"と呼ばれる城を中心に広がる街アイントオークへとやってきた。そしてこの街の収穫祭で、人やポケモンに不思議なパワーを与える幻のポケモン、ビクティニに出会う。そのビクティニのパワーを利用しあることを企む者により、アイントオークはかつてない異変に巻き込まれることに─。

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