天国の存在を信じるのび太。みんなにはバカにされたけど、ドラえもんは自分たちの天国雲の上の王国を造ろうといってくれた。そこで、スネ夫たちの力も借りて、ついに雲の王国を誕生させることができる。ところが、そこへ謎の円盤が侵入。のび太たちは、雲の上の世界にすむ、地上の人とは違う人々のことを知ることになる。