同名人気コミックスを実写映画化。明治維新後の滋賀県大津。数百年に渡って町の治安を守ってきた曇神社。第14代当主・曇天火と次男・空丸、三男・宙太郎は、300年に一度、曇り空が続く時、人々に災いをもたらすと言われているオロチの復活を阻止しようとしていた。その一方で、オロチの力で明治政府転覆を目論む忍者集団・風魔一族が動き出す。

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