コロンビア大学の物理学博士であるエリンは大学の終身雇用の審査のため日夜研究を重ねていた。しかし、以前なりゆきでアビーと行ったゴースト調査のことが知られてしまい、一方的に解雇されてしまう。原因のアビーは今でも助手のジリアと共にゴーストの研究を続けていた。再会したエリンとアビーはたまたま調査に向かった屋敷でついに本物の幽霊と遭遇。それをきっかけに"幽霊退治"専門の「ゴーストバスターズ」を起業することに。ニューヨークを知りつくすパティとボンクライケメンのケヴィンを迎え入れ本格的な幽霊退治に乗り出すことになるが-。